灰原虽重伤在身留院观察，却以幕后人的身份协助FBI和CIA屡次破坏组织的任务，甚至切断了组织一股极为重要的经济源，这让组织Boss十分恼怒，命令潜伏在工藤家的Rum伺机而动杀了工藤夫妇重创众人。但此时的Rum已经逐渐沉溺于工藤心蕊这个身份中，并也逐渐意识到当年的事情确有隐情，不忍心对工藤夫妇下手，但Boss以Hennessy的性命作为要挟，让工藤心蕊夹在中间左右为难。工藤新一察觉到工藤心蕊的矛盾纠结，私下找灰原询问，灰原也隐约知道Hennessy和工藤心蕊的关系，将猜想告诉了众人。工藤夫妇知道这件事情以后，坦率地和工藤心蕊摊牌，希望和工藤心蕊合力救出Hennessy，如果行动失败，他们愿意跟工藤心蕊回组织以换取Hennessy的暂时安全，工藤心蕊深受感动，第一次发自内心地叫了声爸妈。工藤心蕊将自己所知道的一切告诉众人后，众人便开始着手计划，并拟定了行动时间。工藤有希子担心行动失败后便与女儿天人永别，在行动前一天提出与工藤心蕊出门逛街，工藤心蕊欣然答应。但两人在逛街的途中竟意外遇见了组织的人，工藤心蕊急于保护工藤有希子，便自己一个人追了上去，但当她把人追丢回来的时候却听到一声枪响，循声而去，竟看到倒在血泊里的Hennessy和正举着枪的工藤有希子。确定Hennessy已经断气死亡后，工藤心蕊几乎发疯，举枪便要杀了工藤有希子，但最终没狠下心，抱着Hennessy的尸体独自离开了。

意外的发生令众人都十分震惊，而与此同时，FBI和CIA又传来组织反攻的消息，组织以惊人的速度查找到了他们数个“安全屋”的位置，并暗杀了他们数十名线人，扰乱了众多行动计划，让FBI和CIA受到重创，而且据传来的消息，这些行动的指挥和幕后就是组织第一杀手的Gin。众人明白这是组织在进行反攻了，虽然经历了之前的几场巨变，众人现在也是元气大伤，但灰原还是只能硬撑着联系各方着手防御和回击。而经历了Hennessy死亡的Rum，在埋葬了Hennessy后便回到了组织，并以自伤手臂，像胳膊上连开三枪的方式向Boss赔罪，且再次请求刺杀工藤家。Boss同意了Rum的请求，并派四大杀手之一的Margaret协助Rum。Rum得到了Boss的同意后，便又伤心地回到以前Hennessy的住所，Hennessy已经死了，按组织的规矩她的一切物品都将被焚毁。Rum来到Henness